Описание
Грамотрицательная фитопатогенная бактерия Acidovorax citrulli вызывает опасное заболевание — бактериальную пятнистость тыквенных культур. К патогену восприимчивы такие экономически значимые растения, как арбуз, дыня, тыква, огурец, кабачок, патиссон. Возбудитель является карантинным объектом для Республики Беларусь, стран Евразийского экономического союза и стран, входящих в Европейскую и Средиземноморскую организацию по карантину и защите растений (EPPO A1 list).
Набор разработан на основе рекомендаций Европейской и Средиземноморской организации по карантину и защите растений (EPPO) и позволяет детектировать ДНК патогена методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Мишенью для амплификации является участок гена mcpQ Acidovorax citrulli. Внутренний контроль (ВКО) разработан на основе последовательности генов 18S рибосомной РНК. Зонд TaqMan® к участку генома Acidovorax citrulli несет на 5’-конце метку-краситель FAM. ВКО-специфичный зонд мечен флуорофором HEX, что позволяет пользователю валидировать этап экстракции ДНК из растений.
Принцип действия
Принцип действия набора реагентов «ALSENSE» для выявления Acidovorax citrulli методом ПЦР-РВ заключается в проведении полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (ПЦР-РВ) с гибридизационнофлуоресцентной детекцией на матрице ДНК. В основе метода ПЦР лежит многократное удвоение определённого участка ДНК при помощи ДНК полимеразы в искусственных условиях (in vitro). В результате нарабатываются копии ДНК в достаточном для достоверного определения результата количестве. В ходе реакции копируется только заданный участок ДНК, удовлетворяющий условиям специфичности, заложенным в структуре праймеров и флуоресцентного зонда, и только в том случае, если он присутствует в исследуемом образце.
Состав набора
- SAC-107-24
- SAC-107-96
«ALSENSE Acidovorax citrulli» (SAC-107-24, 24 реакции):
- 2x PCR mastermix AC – 1 пробирка;
- ПКО AC – 1 пробирка;
- ОКО – 1 пробирка.
«ALSENSE Acidovorax citrulli» (SAC-107-96, 96 реакций):
- 2x PCR mastermix AC – 4 пробирки;
- ПКО AC – 1 пробирка;
- ОКО – 1 пробирка.